The lack of simplicity in sequence-fitness relationships
本論文は、ランク順序法と符号付き双錐体という新たな指標を通じて検出可能な局所的な高次相互作用が、抗菌薬耐性などの進化過程における配列と適応度の関係の複雑さに関する矛盾する知見を統合すると主張する。
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evolutionary biology
261 件の論文
進化生物学は、生命がどのように時間とともに変化し、多様な姿を形成してきたかを解き明かす分野です。遺伝子の働きから種間の関係まで、過去の証拠と現在の観察を結びつけることで、私たちの存在のルーツに迫ります。
Gist.Science は、bioRxiv から投稿される進化生物学の新しいプレプリントをすべて収集し、専門用語を噛み砕いた解説と、技術的な詳細をまとめた要約の両方をご用意しています。これにより、専門家だけでなく広く一般の方々が、最先端の研究成果をスムーズに理解できます。
以下に、進化生物学の最新プレプリントの一覧をご紹介します。
Genome-wide architecture of prolonged starvation adaptation in experimentally evolved Drosophila and comparative enrichment in human orthologs
本研究は、ショウジョウバエを用いた 60 世代にわたる実験的進化を通じて、長期飢餓への適応がミトコンドリア経路および TOR/S6K シグナル伝達を中心とした広範かつ並行的なゲノム再編成を伴うことを明らかにし、これらの選択された遺伝子のヒト相同遺伝子において、自然集団内で分化した変異が有意に富化されていることを示している。
Parallel evolution of full-length genomes in a long-term evolution experiment with phage ΦX174
ファージΦX174 に対する高スループットシーケンシングと長期進化実験を組み合わせることで、研究者らは、独立した集団が単一部位変異だけでなく、しばしば平行して全長ゲノムを進化させたことを発見し、これは中立性ではなく選択によって駆動されるパターンであり、標準的な系統動態的移動分析に著しい偏りを生じさせる。
First report of stop codon reassignment to tryptophan in members of the bacterial phylum Actinomycetota
本研究は、哺乳類腸内共生菌のゲノム証拠がobligate共生に関連する2つの独立した進化イベントと3つの新属の提案を明らかにする、Eggerthellaceae科に特化したActinomycetota門におけるUGA終止コドンのトリプトファンへの再割り当ての初発見を報告する。
Experimental evolution to thermal stress indicates climate resilience in a cosmopolitan arthropod
本研究は、実験的進化とマルチオミクス解析を通じて、アブラムシが協調的な遺伝子変異、エピジェネティックな調節、および代謝の再プログラミングを介して対照的な熱環境に迅速に適応することを示し、気候変動に対するその顕著な回復力を浮き彫りにしている。
Getting a head: Evidence for a conserved anterior head patterning gene network in arthropods
本研究は、*hedgehog*、*orthodenticle*、および*odd-paired*を含む保存された遺伝子ネットワークが、クモと昆虫の両方で前頭部分節を調節することを示しており、分節構成の違いにもかかわらず、このパターン形成メカニズムの進化的起源が古くまで遡ることを示唆している。
Eco-evolutionary dynamics and environmental detoxification jointly shape bacterial community response to antibiotic perturbation
本研究は、抗生物質の曝露履歴が、共進化的および環境的フィードバックを介して細菌群集の応答を再編成し、耐性プリミングが進化による耐性と環境の解毒作用を通じて即時的な攪乱を緩和する一方で、最終的には競争的優位性を強化し、群集の多様性と回復を制限するトレードオフを生み出すことを示している。
Constitutive and inducible fibrosis explain immune variation among threespine stickleback populations
本研究は、野生個体群における免疫調査と共通庭園実験を組み合わせることで、遺伝的に決定された構成的線維化と環境的に誘導される可塑性を有する線維化の両方が、スジエソの集団固有の免疫変異を駆動し、*Schistocephalus solidus* に対する防御を湖の富栄養化の生態学的差異と結びつけていることを明らかにした。
PhytClust: Efficient and Optimal Monophyletic Partitioning of Rooted Phylogenetic Trees
PhytClustは、ユーザーによる閾値設定を必要とせず、系統樹のトポロジーと枝長の両方を考慮して、計算効率が高く再現性のある最適な単系統群への分割を可能にする新しいアルゴリズムです。
Centromeric variation is shared across ploidy barriers in Alnus glutinosa agg.
この論文は、ヨーロッパのハンノキ属（Alnus glutinosa）において、染色体数（倍数性）の違いによる生殖的隔離を越えてゲノム全体で交雑が見られる中、特に着粒体周辺領域でその交雑が顕著に生じており、これは「着粒体ドライブ」というメカニズムが倍数性の壁を打破する要因として働いている可能性を提案するものである。